立法院民進黨團總召柯建銘將於下週出版新書《大局，承擔》，細數如何帶領黨團以小博大，對抗完全執政的國民黨，揭露背後策略佈局與政治運作的奧秘。 （記者曾韋禎翻攝）
〔記者曾韋禎／台北報導〕立法院在2013年5月31日深夜三讀通過「會計法第99條之1修正案」，將2010年12月31日前，各民意機關與特別費相同性質的所有費用，及2011年12月31日前的學術研究費，皆予除罪，引發譁然。立法院民進黨團總召柯建銘在新書《大局，承擔》中感嘆，這是當年檢察總長黃世銘對學術界進行全面整肅，為救援台灣學術界，才承擔修法的惡名。
「會計法」修法是外界最常拿來攻擊所謂「密室協商」的案例。柯建銘在新書透露，前總統陳水扁在2008年520卸任前曾提醒，特別費一定要除罪化，可不列入國務機要費，但必須解決其他人的問題。
立法院民進黨團因此提出針對特別費除罪化的修正草案。甚至還有馬政府的政務官向柯訴苦，表示自己被調查到需要安眠藥才能入睡，連紅、白帖都被一張一張查。但直到陳水扁已經入監，國民黨團才同意修法，於2011年率先將行政首長除罪化。
但包括總統、各級民代、學者都尚未除罪。而前立委顏清標因在台中縣議長任內喝花酒報公帳遭到判刑；立法院無盟黨團為此急於修法，不過柯建銘認為此案必須公開討論、表決，卻均遭國民黨拒絕。
同時，黃世銘也決定從嚴偵辦學術界研究費案，全國有1500位國立大學教職員涉案，就連台北市長柯文哲、台大校長楊泮池都被捲入。台聯立委林世嘉為此找立法院長王金平推動修法。
2013年5月，朝野已有民代與學者一起解套的共識。5月31日的協商，各黨陸續簽署，也請行政院表示意見，並使用行政部門修改的文字內容。結果最後的三讀版本，卻漏寫「教」字，反而排除掉學術單位。
原本「共同承擔」的共識，也因為這個缺漏，遭到無情推翻，由各黨團領袖承受所有指責。行政院遂在社會壓力下提出覆議，讓一切回歸原點。
直到顏大和接任檢察總長後，最高法院做出統一見解，不將教授視為授權公務員，化解台灣學術界的重大危機。
柯文哲則在推薦序上表示，早就該修正「會計法」，當時的學術界有這麼多人涉案，卻沒人敢對這個惡法開槍，根本是知識分子的懦弱。
柯文哲稱許柯建銘一間扛起藍綠共業的原罪，承擔污辱與罵名，歷史最後還是會還他一個公道。
